印尼馬魯古群島穆斯林和基督徒之間的教派衝突愈演愈烈，最近一次連續六天爭鬥不能停止，瓦希德總統於六月二十六日宣佈該區進入民事緊急狀態。

瓦希德總統表示，他已執掌馬魯古群島的最高保安控制權，過去一周該地已有數十人喪生。他在召開主要閣員特別會議後對記者說：「局勢已經失控。」他說緊急狀態將維持到恢復和平為止。

民事緊急狀態僅低於戒嚴令（軍管）一級。民事緊急狀態的許多要項已經實行，准許保安部隊入屋搜查、拘捕嫌疑犯和實施宵禁。

自教派衝突於一九九九年一月爆發以來，已有數千人死於非命。在最近爆發的已歷時一周的打鬥中，主島安汶和北部的哈馬里拉島已有逾一百五十五人被殺。星期一安汶市內到處槍聲、爆炸聲亂成一片。居民說，暴徒縱火燒掉幾座大廈，不過暫無傷亡報導。但是目擊者說，最少兩人被殺，一座清真寺和數十所民居被燒毀。過去六天來安汶市最少有五十五人被殺，過去八天該群島北部一個基督徒村莊受到穆斯林襲擊，一百多人死亡。

穆斯林游擊隊六月二十日來到印尼馬魯古群島的杜馬村之後發動襲擊，殺死超過一百名基督徒。儘管政府軍加強巡邏，但教派暴力繼續在馬魯古發生。

教會領袖和示威者要求聯合國干預，安汶羅馬天主教大主教泰圖爾對死亡人數迅速增加感到震驚，他指出印尼軍方沒有能力維護和平，他並指責許多士兵不稱職和偏袒。