師尊蓮生活佛在第212冊新書《盧勝彥的機密檔案》其中「宗喀巴檔案」一文，關於弟子「師尊是否是宗喀巴祖師轉世」之問，師佛說：「我在講解宗喀巴《密宗道次第廣論》時，宗喀巴親自現身虛空中，放百寶光明，其光明柔柔綿綿密密，其光如絲，蜿轉旋轉，實在是太殊勝了。（我絕不妄語）我融入宗喀巴身中。宗喀巴入我身中。直到我把《密宗道次第廣論》講解完畢。我與宗喀巴如此的親密，我也沒有什麼話可以說了。」

宗喀巴祖師為創立黃教的始祖，制定轉世的制度，注重戒律、實修和學術的研究，黃教在明朝中葉達到鼎盛時期，興旺與聲譽遠遠超過其他教派。而師尊蓮生活佛創建真佛宗，集黃教傳承的精髓於一身，實修方面亦有驗有證，所以密宗很多仁波切認為蓮生活佛是宗喀巴祖師的轉世。

宗喀巴祖師第一百世代表甘丹赤巴，親自赴西雅圖專訪蓮生活佛贈法王衣袍，並共同登法座主持法會。當時作為《真佛報》社長的我，因身兼採訪之職，非常榮幸地見證了這一盛舉。這樣的特殊因緣，正是冥冥之中的相應，證明師尊與宗喀巴是有很深的關係。

當年師尊講解《密宗道次第廣論》的法語開示，被灌製成CD廣泛流傳。當時我也有一套，聽後受益良多。其中有一件非常奇妙的經歷，令我記憶猶新。一天早上，我剛剛睜開雙眼，忽然看到播放「密宗道次第廣論」的CD Player上方，現出宗喀巴祖師金光閃閃的法像，身穿金黃色法王袍，頭戴法王帽，與華光雷藏寺壇城供奉的宗喀巴祖師的法像完全一樣。但是我知道，這是師尊與宗喀巴祖師的融合體，因為，我看到的是師尊的臉。

這是我第一次在白天，而且是睜著眼睛看到宗喀巴祖師顯現，這樣的經歷令我更加的堅信，師尊與宗喀巴祖師是融入的，是不二的。蓮生活佛講解「密宗道次第廣論」，即是宗喀巴祖師的說法開示。所以師尊說：「我也沒有什麼話可以說了。」意思是我與宗喀巴如此的親密，誰是蓮生活佛？誰是宗喀巴祖師？如何分割呢？