有一些行者問到修水供法時所遇到的一些疑問，茲說明如下：

問：三層水供塔供品如何放？

答：上層可供如珍珠瑪瑙等珍貴的供品，中層可供如芝麻、五穀、牛奶等清淨的供品，下層可供如肉類、肉乾等較油膩的供品。在獻供時可結供養印，可結五供印。供養天人必有香花，必有香水；供奉龍天護法，必有酒、肉一起供養。供養時可觀各色光明加持。有時獻供藥材可祈願加持行者氣血通暢，這一部份的稟報要清楚明白。

問：護摩後的供品應如何處理？

答：有些如衣服、珠寶以及裝飾品可以保留，有些可燒化，供後不可再供。有些食品供後可拿來煮食。如八供中的海螺，塗香可以繼續使用，基本上每一物供過後不可再重複使用，但八供可重複使用。燈可點、可不點。供酒者，供後不喝者，可倒掉。水供後清淨的水可留下，做灑淨、淨身用。藥材可煮來吃。其他下層的供品可經過瀘網過瀘後再處理。

問：那些東西不能供？

答：主尊為佛菩薩時，只要你喜歡的清淨物品，皆可獻供。如主尊為財神、護法金剛神時，可供奉如肉類、葷食(生、熟皆可)、烈酒等。行者修法時真誠、用心，自能相應。

問：獻供與演化手印如何配合？

答：一般而言，依供品多寡來決定演化手印的次數及修法的時間長短。基本上每獻供約三分之一便可演化供養手印，再結主尊手印，如此行之，再獻供，再演化手印。

問：為什麼修水供法，每一次以同一主尊較好？

答：每一次修水供，固定相同的主尊，行者一直跟此尊結緣，會形成主尊與護法的護佑網，達到最好的相應。